Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CTLA4P16410 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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