Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP2AP11388 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms