Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC175P0C221 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC175P0C221 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms