Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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PTPRCP08575 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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PTPRCP08575 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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PTPRCP08575 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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PTPRCP08575 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRCP08575 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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