Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYBBP04839 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYBBP04839 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYBBP04839 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYBBP04839 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYBBP04839 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYBBP04839 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms