Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOC2P02655 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOC2P02655 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOC2P02655 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms