Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIN3BO75182 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms