Protein–RNA interactions for Protein: O43174

CYP26A1, Cytochrome P450 26A1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26A1O43174 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP26A1O43174 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP26A1O43174 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms