Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GOLGA6L9A6NEM1 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms