Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL33A6NCF5 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.7 ms