Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNPO3Q9Y5L0 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNPO3Q9Y5L0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms