Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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