Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
USP20Q9Y2K6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
USP20Q9Y2K6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms