Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNAL1Q9UBT7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms