Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KCNK4Q9NYG8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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