Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM248Q9NWD8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms