Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMILIN3Q9NT22 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EMILIN3Q9NT22 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms