Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOBEC3GQ9HC16 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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