Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BRIP1Q9BX63 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRIP1Q9BX63 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms