Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS5

TRMT61B, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61BQ9BVS5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRMT61BQ9BVS5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMT61BQ9BVS5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms