Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ATG101Q9BSB4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms