Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms