Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPS6KC1Q96S38 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms