Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP3Q96P47 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms