Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPRD1AQ96P16 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms