Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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SAMD8Q96LT4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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SAMD8Q96LT4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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SAMD8Q96LT4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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SAMD8Q96LT4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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SAMD8Q96LT4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SAMD8Q96LT4 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SAMD8Q96LT4 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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SAMD8Q96LT4 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SAMD8Q96LT4 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SAMD8Q96LT4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD8Q96LT4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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