Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
C2orf48Q96LS8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms