Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CPNE2Q96FN4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms