Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGF29Q96ES7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms