Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-CQ95604 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-CQ95604 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms