Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SCG3Q8WXD2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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