Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DTX3LQ8TDB6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms