Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
GDPD1Q8N9F7 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms