Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC50Q8IVM0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms