Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNA2D4Q7Z3S7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms