Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 GCM1-201ENST00000259803 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CTH-203ENST00000411986 2044 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ARL13B-201ENST00000303097 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C16orf54Q6UWD8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms