Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ANKRD54Q6NXT1 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms