Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A4Q6AI14 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms