Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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FAM78BQ5VT40 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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FAM78BQ5VT40 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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FAM78BQ5VT40 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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FAM78BQ5VT40 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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FAM78BQ5VT40 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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FAM78BQ5VT40 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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FAM78BQ5VT40 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FAM78BQ5VT40 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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