Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PKDCCQ504Y2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms