Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TTLL9Q3SXZ7 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms