Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWISTNBQ3B726 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms