Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CDO1Q16878 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CDO1Q16878 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CDO1Q16878 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CDO1Q16878 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CDO1Q16878 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CDO1Q16878 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CDO1Q16878 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CDO1Q16878 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CDO1Q16878 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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CDO1Q16878 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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CDO1Q16878 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDO1Q16878 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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