Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CTF1Q16619 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CTF1Q16619 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CTF1Q16619 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CTF1Q16619 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CTF1Q16619 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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