Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CAMK4Q16566 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAMK4Q16566 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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