Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SSX1Q16384 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms