Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NTRK3Q16288 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms