Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GRIK4Q16099 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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