Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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PUM3Q15397 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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PUM3Q15397 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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PUM3Q15397 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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PUM3Q15397 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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PUM3Q15397 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUM3Q15397 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
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