Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
APOFQ13790 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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APOFQ13790 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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APOFQ13790 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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APOFQ13790 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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APOFQ13790 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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APOFQ13790 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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